В ролях:
Джо Флениган, Тори Хиггинсон, Девид Хьюлет, Рэйчел Латрелл, Рейнбоу Франкс, Пол МакГиллон

Команде Атлантиды удалось остановить флот рейфов, не дав им достигнуть Земли. Потерпев очередную неудачу с ретровирусом, команда встречает третий год в галактике Пегас, всё еще находясь под опасностью нападения рейфов. Также в новом сезоне они находят еще более страшных врагов — расу асуранцев. Кроме того, в результате неудачного эксперимента они полностью разряжают свой МНТ и снова остаются без связи с Землей и защитного поля города.